Dua virus besar, dalam edisi jurnal Science minggu ini telah dijuluki "Pandoraviruse" karena kejutan yang mereka berikan kepada para ahli biologi, mirip dengan tokoh mitos Yunani yang membuka kotak dan melepaskan kejahatan ke dunia.
Tapi kita tidak perlu panik. Family virus baru ini hidup di air dan tidak menimbulkan ancaman besar bagi kesehatan manusia.
 |
| Gambar mikroskop elektron dari partikel Pandoravirus (diedit menggunakan filter artistik Adobe Photoshop) |
"Penemuan besar tetap harus dilakukan pada tingkat yang paling mendasar yang dapat mengubah konsepsi kita sekarang tentang asal usul kehidupan dan evolusinya," kata Claverie.
Eugene Koonin, biolog komputasi evolusioner di National Center for Biotechnology Information in Bethesda, Md., yang tidak terlibat dalam penelitian ini, mengatakan bahwa Pandoraviruses adalah sebuah "penemuan indah," tapi juga kejutan yang belum lengkap.
Penemuan
Claverie menemukan salah satu virus, Pandoravirus salinus, dalam sedimen yang dikumpulkan di lepas pantai Chile. Yang lainnya, Pandoravirus dulcis, ditemukan di lumpur di kolam air tawar dekat Melbourne, Australia.
Kedua virus baru yang begitu besar sehingga mereka dapat dilihat dengan menggunakan mikroskop cahaya (optik) biasa. Genom mereka juga berukuran super: genom P. salinus 1.91 juta basis DNA, sedangkan P. dulcis 2.47 juta basis DNA. Sebagai perbandingan, ukuran virus pemegang rekor sebelumnya, Megavirus chilensis, genom 1.18 juta basis.
M. chilensis masuk dalam Mimiviruses, kelas virus besar yang pertama kali ditemukan lebih dari satu dekade yang lalu dan selamanya mengubah konsepsi para ilmuwan tentang seberapa besar sebuah virus dapat menjadi.
 |
| Gambar ini menunjukkan genom Megavirus chilensisa, pemegang rekor sebelumnya untuk virus terbesar, dengan 1.200 gen. Dua virus yang baru ditemukan dua kali lebih besar dan mungkin merupakan bentuk kehidupan yang sama sekali baru |
Setelah sekuensing genom Mimivirus pertama tahun 2010, Claverie dan timnya mulai melakukan pencarian sistematis untuk virus yang lebih besar. Mereka menemukan P. salinus di lingkungan yang sama di Chili di mana M. chilensis ditemukan.
Penemuan P. dulcis lebih kebetulan, adalah hasil dari sampel air yang Claverie ambil selama perjalanan ke Melbourne.
Pada awalnya, para ilmuwan Perancis berpikir kedua virus adalah virus yang sama. Tapi setelah membandingkan dua sekuens genom dan kode protein mereka, para ilmuwan menyadari bahwa kedua virus ini mewakili family baru dari virus.
Viruskah?
Tim juga melakukan beberapa percobaan untuk mengkonfirmasi bahwa Pandora memang virus. Menggunakan mikroskop cahaya dan elektron, para ilmuwan megamati entitas baru mereka melalui siklus replikasi lengkap. Entitas raksasa memenuhi semua tiga kriteria utama untuk bisa disebut virus.
 |
| Virus Pandora |
Selanjutnya sebuah kejutan menunggu tim ketika mereka menganalisis genom Pandoraviruses. Mereka menemukan bahwa P. dulcis berisi sekitar 1.500 gen, sedangkan P. salinus berisi lebih dari 2.500 gen. Sebuah virus flu yang khas dapat memiliki sedikitnya 10 gen, dan M. chilensi hanya memiliki sekitar 1.000 gen.
Terlebih lagi, para ilmuwan tidak tahu apa yang sebagian besar gen Pandoravirus lakukan. "Hanya ada sebuah gen yang dikenali yang terlibat dalam replikasi DNA dan transkripsi gen, selain itu tidak banyak lagi yang dikenali," jelas penulis studi Matthieu Legendre, yang juga berada di CNRS.
Pandoraviruses juga tidak seperti virus lainnya, mereka tidak memiliki gen untuk protein kapsid yang biasanya membentuk housing, atau "capsid," virus-virus raksasa.
Domain keempat
Penyimpangan ini menimbulkan pertanyaan menarik tentang asal-usul Pandoraviruses. Menurut teori yang diusulkan oleh Claverie dan timnya, nenek moyang kuno Pandoraviruses dahulunya adalah sel yang hidup bebas yang secara bertahap kehilangan sebagian besar gen mereka saat mereka menjadi parasit.
Beberapa ilmuwan berpikir sel leluhur hipotetis ini bisa merupakan apa yang disebut "domain keempat" dalam kehidupan - yaitu, sebuah cabang yang sebelumnya tidak didefinisikan ada dalam kehidupan. Sebelumnya hanya ada tiga domain: Bakteri, Archaea, jenis lain dari organisme bersel tunggal , dan Eukariota, domain yang hewan dan tanaman milik.
Aplikasi praktis
Claverie dan timnya sekarang berburu untuk menemukan Pandoraviruses lain untuk mengungkap asal evolusi mereka dan mempelajari gen mereka dengan lebih seksama.
 |
| Virus Pandora |
"Menjelaskan fungsi biokimia dan fungsi- fungsi regulatoris mereka mungkin akan menjadi ketertarikan yang luar biasa bagi aplikasi bioteknologi dan biomedis," tambahnya.
Para ilmuwan memiliki alasan untuk percaya bahwa ada lebih banyak Pandoraviruses yang menunggu untuk ditemukan.
"Fakta bahwa dua dari mereka ditemukan hampir bersamaan dari lokasi yang sangat jauh menunjukkan bahwa "kami sangat beruntung" atau "mereka tidak langka" kata Claverie.
Baca Juga:
Source
